元素周期表#

数字上标与下标#

• 上标：⁰¹²³⁴⁵⁶⁷⁸⁹⁺⁻
• 下标：₀₁₂₃₄₅₆₇₈₉₊₋

化学分子结构表达#

分子式#

Molecular Formula

有些分子式相同，但却是不同的分子（同分异构），e.g. C₆H₁₂O₆，可以是葡萄糖，也可以是果糖。

e.g. 水 H₂O，Fe₂(SO₄)₃

SMILES 线性结构式#

• [] 组合表达
• () 支链（挂在旁边的基团）
• = 双键

e.g. 葡萄糖的开链（直链）结构 OCC(O)C(O)C(O)C(O)C=O

SMILES 立体结构式#

• 第一个 1：开始环
• 第二个 1：结束环
• @ 朝某一边
• @@ 朝另一边

e.g. 葡萄糖的闭链（六元环）结构 OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O

e.g. 果糖的闭链（五元环）结构 C([C@@H]1[C@H]([C@@H]([C@](O1)(CO)O)O)O)O

SMILES -> 图片#

# pip install rdkit
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import Draw

mol = Chem.MolFromSmiles("OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O")
Draw.MolToImage(mol, size=(500, 300)).save("./chem.png")
print("saved: chem.png")

反应方程式#

基团#

• 羟基 OH （去氧与氢的合体字，读 qiang3）
• 醛基 C=O（读 quan2）